Omega Speedmaster Professional เองก็เป็นหนึ่งในอุปกรณ์ที่ถูกสวมใส่โดยนักบินอวกาศที่ดำรงตำแหน่งผู้บัญชาการภารกิจอย่าง Jim Lovell รวมถึงนักบินอย่าง Jack Swigert และ Fred Haise พวกเขาเริ่มปฏิบัติภารกิจ Apollo 13 ในวันที่ 11 เมษายน 1970 ซึ่งภารกิจที่สามที่พวกเขาต้องทำคือการลงจอดบนดวงจันทร์ นอกจากนั้น Apollo 13 ยังเป็นโครงการทางวิทยาศาสตร์อีกโครงการหนึ่งที่เกี่ยวข้องกับการขุดเจาะหลุมลึก 3 เมตร จำนวน 2 หลุม เพื่อทดสอบเครื่องวัดแผ่นดินไหว รวมถึงการวัดโปรตอนและอิเล็กตรอนของดวงอาทิตย์ถึงดวงจันทร์และอื่น ๆ อีกมากมาย

ในระหว่างการดำเนินภารกิจ เมื่อยานอวกาศกำลังจะลงจอดก็ประสบกับปัญหาร้ายแรงในขณะเข้าใกล้พื้นผิวดวงจันทร์ ในขณะนั้นลูกเรือได้ยินเสียงระเบิดที่ค่อนข้างดัง จึงทำให้รู้ว่าเกิดวิกฤตถังออกซิเจนระเบิดมาพร้อมกับความผันผวนของพลังงานไฟฟ้าและอุปสรรคอื่น ๆ อีกมากมาย ด้วยวิกฤตและปัญหาที่เกิดขึ้น ลูกเรือทั้งหมดจึงรีบย้ายตัวเองไปรวมอยู่ที่ Lunar Module โชคร้ายที่ยานลำนี้ไม่ได้ถูกออกแบบให้รองรับลูกเรือได้พร้อมกันหลายคน และเพื่อประหยัดพลังงานให้มากที่สุด จึงต้องทำการปิดระบบเกือบทุกระบบ ดังนั้นนาฬิกาจับเวลาแบบดิจิตอลจึงไร้ประโยชน์โดยทันที เรียกว่าด้าน NASA เอง ก็ต้องแข่งกับเวลาเพื่อแก้ปัญหาที่ยิ่งรุนแรงขึ้นเรื่อย ๆ เมื่อรอไม่ได้ ทีมผู้เชี่ยวชาญจาก Omega จึงถูกเรียกตัว และด้วยวิถีการเคลื่อนตัวของยานที่ผิด จึงมีโอกาสที่ยานจะถูกเหวี่ยงกลับไปสู่ห้วงอวกาศที่อยู่นอกเหนือขอบเขตความช่วยเหลือที่ NASA ช่วยได้ วิธีในการแก้ไขเดียวคือต้องเปิดการทำงานของเครื่องยนต์เป็นเวลาแค่ 14 วินาทีเท่านั้น โดยต้องไม่ขาดหรือเกิน เมื่อทราบเช่นนี้แล้ว หมายความว่าภารกิจนี้เสี่ยงสูงมากและไม่สามารถผิดพลาดได้ บนยาน Apollo ขณะนั้นเมื่อไม่มีนาฬิกา Digital ผู้บัญชาการอย่าง James Lovell จึงใช้ Omega Speedmaster ในการจับเวลาการเผาไหม้ของเชื้อเพลิง ในที่สุดการเปลี่ยนวิถีของยานก็ประสบความสำเร็จและสามารถกลับสู่โลกได้อย่างปลอดภัย